Структура Республиканского клинико-диагностического центра включает в себя такие подразделения, как:

• - Администрация;
• - Диагностика;
• - Поликлиника;
• - Стационар;
• - Хирургическая служба;
• - Акушерско-гинекологическая служба;
• - Педиатрическая служба;
• - Реабилитационная служба;
• - Отдел выездной специализированной медицинской помощи;
• - Организационно-методическая служба;
• - Клинико-экспертный отдел;
• - Отдел оказания медицинской помощи пациентам застрахованным по добровольному медицинскому страхованию (ДМС);
• - Отдел организации платной медицинской помощи (отдел ОПМП).

Специализированная, в том числе высокотехнологичная, медицинская помощь при заболеваниях, требующих специальных методов диагностики, лечения и использования сложных, уникальных или ресурсоемких медицинских технологий:

• - Амбулаторно-поликлиническая медицинская помощь.
• - Стационарозамещающая помощь (дневной стационар при поликлинике и стационар дневного пребывания).
• - Стационарная круглосуточная медицинская помощь.
• - Диагностические исследования.
• - Реабилитационные мероприятия.